Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD247P20963 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD247P20963 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD247P20963 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD247P20963 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD247P20963 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD247P20963 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD247P20963 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD247P20963 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD247P20963 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms