Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF3P17036 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF3P17036 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms