Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB1P16220 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB1P16220 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB1P16220 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CREB1P16220 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB1P16220 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB1P16220 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB1P16220 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB1P16220 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB1P16220 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CREB1P16220 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms