Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACADSP16219 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSP16219 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSP16219 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSP16219 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSP16219 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACADSP16219 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACADSP16219 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACADSP16219 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACADSP16219 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACADSP16219 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms