Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms