Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPB41P11171 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB41P11171 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPB41P11171 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPB41P11171 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB41P11171 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB41P11171 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms