Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRFP10586 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRFP10586 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms