Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CGB3P0DN86 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms