Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms