Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAPPC2BP0DI82 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms