Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PKHD1P08F94 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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