Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGAP02671 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGAP02671 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGAP02671 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGAP02671 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGAP02671 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGAP02671 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGAP02671 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms