Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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