Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD3O95983 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD3O95983 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD3O95983 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD3O95983 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD3O95983 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD3O95983 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD3O95983 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD3O95983 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD3O95983 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD3O95983 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD3O95983 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms