Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJB6O95452 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJB6O95452 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB6O95452 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB6O95452 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB6O95452 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB6O95452 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB6O95452 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms