Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.14
SOGA1O94964 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SOGA1O94964 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOGA1O94964 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms