Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM2O94769 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM2O94769 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM2O94769 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM2O94769 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM2O94769 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM2O94769 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM2O94769 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM2O94769 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECM2O94769 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms