Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRMUO75648 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRMUO75648 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRMUO75648 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRMUO75648 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRMUO75648 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRMUO75648 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRMUO75648 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms