Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F6O75461 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F6O75461 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F6O75461 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F6O75461 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F6O75461 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F6O75461 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F6O75461 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F6O75461 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms