Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PITX3O75364 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX3O75364 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX3O75364 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PITX3O75364 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PITX3O75364 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PITX3O75364 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms