Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms