Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLR5O60602 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLR5O60602 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TLR5O60602 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TLR5O60602 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TLR5O60602 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TLR5O60602 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TLR5O60602 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLR5O60602 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLR5O60602 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLR5O60602 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLR5O60602 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TLR5O60602 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms