Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUPR1O60356 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUPR1O60356 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUPR1O60356 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUPR1O60356 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUPR1O60356 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUPR1O60356 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUPR1O60356 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NUPR1O60356 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NUPR1O60356 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUPR1O60356 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUPR1O60356 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms