Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHMP2AO43633 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP2AO43633 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms