Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CBFA2T2O43439 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms