Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NUPL2O15504 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms