Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN2DO15399 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms