Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF646O15015 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF646O15015 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms