Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX39AO00148 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX39AO00148 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms