Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
J3KT08 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
J3KT08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
J3KT08 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
J3KT08 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
J3KT08 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
J3KT08 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms