Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms