Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L12C9JPN9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms