Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERVV-2B6SEH9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms