Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BECN2A8MW95 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms