Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF839A8K0R7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms