Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM200CA6NKL6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200CA6NKL6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms