Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms