Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF316A6NFI3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF316A6NFI3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms