Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD3L3A6NE82 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MBD3L3A6NE82 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms