Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSDA5PKW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSDA5PKW4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms