Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XIRP2A4UGR9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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