Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM30A4D0T7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms