Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F8A0AVK6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F8A0AVK6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms