Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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