Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX16Q9Y5Y5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX16Q9Y5Y5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX16Q9Y5Y5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX16Q9Y5Y5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX16Q9Y5Y5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX16Q9Y5Y5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX16Q9Y5Y5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX16Q9Y5Y5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX16Q9Y5Y5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX16Q9Y5Y5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX16Q9Y5Y5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX16Q9Y5Y5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms