Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SUPT16HQ9Y5B9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SUPT16HQ9Y5B9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SUPT16HQ9Y5B9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SUPT16HQ9Y5B9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SUPT16HQ9Y5B9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SUPT16HQ9Y5B9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SUPT16HQ9Y5B9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms