Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNIP3Q9Y2W7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP3Q9Y2W7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNIP3Q9Y2W7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP3Q9Y2W7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNIP3Q9Y2W7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP3Q9Y2W7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms