Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3LQ9Y262 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3LQ9Y262 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3LQ9Y262 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF3LQ9Y262 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3LQ9Y262 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3LQ9Y262 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3LQ9Y262 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3LQ9Y262 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms