Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A1LQ9UNN4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2A1LQ9UNN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1LQ9UNN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1LQ9UNN4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2A1LQ9UNN4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2A1LQ9UNN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms