Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHTF1Q9UMS5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHTF1Q9UMS5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHTF1Q9UMS5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHTF1Q9UMS5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms